Fakultas-fakultas di UIN Sunan Kalijaga
1. fakultas adab dan budaya
2. fakultas dakwah dan komonikasi
3. fakultas ilmu tarbiyah dan keguruan
4. fakultas syariah dan hukumk
5. fakultas usuludin dan pemikiran islam
6. fakultas sain dan teknologi
7. fakultas ilmu sosial dan homoniora
8. fakultas ekonomi dan bisnis islam
9. pascasarjana